基因测序是什么

2024-05-13 21:06

1. 基因测序是什么


基因测序是什么

2. 基因测序是什么

基因检测的基本原理是运用现代分子生物学和分子遗传学检查基因的结构及其表达功能是否正常。基因检测的途径主要有基因突变的检测、基因连锁分析和mRNA检测。最常用的技术有PCR扩增技术,DNA测序技术,生物芯片技术。基因检测主要是在传染性疾病,遗传性疾病,肿瘤中有重要的应用。基因检测对于肿瘤的早期诊断,肿瘤的临床分类,预后,对肿瘤高危人群的筛选指导,个体化治疗和预防都有重要的作用。


3. 基因组测序

问题一:全基因组测序的技术路线  提取基因组DNA,然后随机打断,电泳回收所需长度的DNA片段(0.2~5Kb),加上接头, 进行基因簇cluster制备或电子扩增E-PCR,最后利用Paired-End(Solexa)或者Mate-Pair(SOLiD)的方法对插入片段进行测序。然后对测得的序列组装成Contig,通过Paired-End的距离可进一步组装成Scaffold,进而可组装成染色体等。组装效果与测序深度与覆盖度、测序质量等有关。常用的组装有:SOAPdenovo、Trimity、Abyss等。 
  
   问题二:个人全基因组重测序需花费多少钱?  人类基因组大小3G, 重测序一般需要测定至少20x以上的数据(数据乘数高的话对于信息分析是有海的),也就是说一般需要测定60G的数据,如果1G按照5000元算的话,需要30万元。 
  不过要看你的目的,现在illumina推出的my-seq测1个人的好像只需要几万。 
  
   问题三:什么是基因组测序技术  自1998年美国塞莱拉遗传公司组建以来,人类基因组研究开始由两部分科学家同时展开,分别是由公共经费支持的人类基因组工程和美国塞莱拉遗传公司。在研究过程中,他们也分别采用了两种不同的测序和分析的方法。塞莱拉公司的核心分析方法被称为霰弹法,人类基因组工程则采用了克隆法。 
  所谓霰弹法,其实是一种高度计算机化的方法,它先把基因组随机分成已知长度(2000个碱基对、1万个碱基对、5万个碱基对)的片段,然后用数学算法将这些片段组装成毗邻的大段并确定它们在基因组上的正确位置。 
  塞莱拉公司的科学家先用霰弹法测序DNA,并将整个基因组覆盖8次,然后用两个数学公式将人类基因组序列多次组装起来,确定出基因中的转录单元,预测出60%的已识别基因的分子功能。最后研究人员将人类基因组信息与此前已完成的果蝇和线虫的基因组序列进行比较,从而找出了三者共有的核心功能。 
  而人类基因组工程采用的克隆法则通过先复制更大段的人类基因序列,然后将它们绘制到基因组的适当区域进行研究。这种方法需要研究人员在早期把较多的时间和精力放到克隆和绘制草图上。 
  两个研究组将所得数据进行对比,经人类基因组工程的科学家、《科学》和《自然》杂志高级指导编辑评估,表明塞莱拉公司的基因组分析与人类基因组工程的分析结果虽然存在一些差异,但大部分地方都有极高的吻合度。 
  塞莱拉公司测定的序列覆盖了95%以上的人类基因组,其中约85%的人类基因组存在于按照正确顺序排列、至少包含50万个碱基对的片段中。这一序列为人类至少拥有2.6383万个控制合成蛋白质的基因提供了有力的证据,也为另外1.2731万个假设基因的存在提供了较弱的证据 
  
   问题四:RNA测序与整个基因组测序相比有什么优势?  RNA测序也就是所谓的RNA-seq,通常指的是转录组测序,只测细胞中的转录本。只有基因组中被转录出来的那部分能测到。通常用于寻找差异表达基因以及发现新基因。而基因组测序是整个基因组都测,不管转录不转录,通常用于基因组组装,重测序进行基因分型等。 
  这是根本不同的两个东西,一个是测转录组,一个是测基因组,它们的不同就是转录组和基因组的不同。至于优势,根据自己的目的来判断吧。 
  欢迎追问。 
  
   问题五:个人基因组测序有哪些意义  理论上说,知道了序列,就可以确定这个人的基因,从而能够知道这个人的表型特征,或者对那些病是易感的,以后有可能得什么病,以及对将来对孩子的遗传等等… 
  但目前来说,个人的全基因组还没有什么用,因为现在我们对基因组中序列的信息了解的还太少,如SNP相关疾病,多基因遗传病等。在科研上全基因组测序,可以为我们提供数据库,以便分析相关的特征。 
  随着代号为AK1的韩国人的测序成功,目前世界上只有5个人进行了,全基因组测序,另外四个是:一名非洲优鲁巴人、基因研究的先驱詹姆斯・沃森、克里格・文特和一名代号为YH的中国人。 
  
   问题六:基因组测序的测序深度一般是多少  基因组测序的测序深度一般是10X。 
  测序深度是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值。假设一个基因大小为2M,测序深度为10X,那么获得的总数据量为20M。 
  基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理,如癌症或白血病,运动天赋,酒量等。

基因组测序

4. 基因测序是什么


5. 基因测序的介绍

基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理,如癌症或白血病,运动天赋,酒量等1。基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,可以说基因测序技术,是下一个改变世界的技术1。

基因测序的介绍

6. 世界上有哪些基因测序中心?

英国桑格研究所是世界最著名的基因组测序研究中心之一。它建于1992年,成立初衷是参与人类基因组计划的大规模基因测序,现在的使命是通过基因测序技术让人类更加了解生命本身,诊断和治疗疾病。

研究所位于剑桥郊外,附近是一个18世纪的猎场。从伦敦驱车一个半小时来到研究所,笔者的第一感觉是,这里像是个社区中心。湖畔、草坪、酒吧,看不到穿白大褂的科学家。探寻生命秘密的人只有走进那几栋玻璃幕墙中的实验室时,才会戴上护目镜和橡胶手套。

研究所以英国生物化学家弗雷德里克·桑格的名字命名。桑格被称为“基因组学之父”,曾两度获得诺贝尔奖,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础。

研究所副主任茱莉亚·威尔森告诉我们,研究所成立时,这里只有不到50人,而目前桑格研究所已经超过1000人,其中有80名博士生,120名博士后。研究所的资金主要来自赞助,以5年为一个赞助周期。2016年至2021年的赞助周期内,桑格研究所从惠康基金会获得了4.5亿英镑的赞助,另外预计将从第三方获得1亿英镑的赞助。

威尔森说,研究所主要开展四方面研究:癌症与基因变异、细胞遗传学、人类基因学和寄生虫与微生物。目前一些新的研究项目包括为人体绘制一份谷歌地图、对人体内37万亿个细胞中的一些细胞进行测序和分析。

基因学家们认为,癌症的发生源于基因序列出现异常,因此基因测序可以提前发现患癌风险,并通过药物改变变异基因,最终目标是彻底治愈癌症。

在研究所的基因测序大楼里,玻璃幕墙后放着一层层装满基因数据的硬盘,上面的绿色显示灯不断闪烁。工作人员说,那里面存储的数据如果转换成MP3音乐能连续播放5万年。弄清人体的基因及其序列,就能破译人类遗传信息。因为数据量巨大,每层硬盘上都是近一层楼高的冷却循环设备,以确保硬盘运转时产生的热量及时散发出去。

在研究所的实验室里,一台台读取基因组序列的白色方形机器整齐排列,看起来就像是一台台复印机。这些机器目前可同时读取20个人的基因样本,操作时间仅需45分钟。

研究所里还有一间贴着“社会与伦理研究”字样的工作室。很明显,桑格研究所在开展研究的同时,始终意识到基因研究的争议性。工作室用于和赞助方、研究者、公众和立法者沟通,以尽可能确保信息顺畅、决策科学。

笔者和研究所来自意大利的阿玛托博士聊天。他说,自己曾做过在英国十分流行的“23andMe”基因检测,了解自己可能会遭遇的疾病,但他不会建议自己的母亲做同样的检测,因为担心她没法像自己那样以科学家的冷静态度对待检测结果。

7. 基因测序的应用领域

英国伦敦大学学院和美国罗格斯大学的联合研究团队,将基因测序技术和超级计算机技术相结合,试图探索解决这一命题。研究人员把艾滋病(HIV)蛋白酶分子作为对象,酶在不同人体中形状略有不同,尤其是在蛋白质活动区,在那里酶完成切片并构成了下一个病毒,进而形成特定的病毒基因序列。如果知道了酶的形状,就可以找到相应的药物来阻止这一过程。研究人员通过模拟人体中不同形状的艾滋病病毒感染的关键蛋白质,演示了由计算机优化给出的多种艾滋病治疗药物疗效的排序清单。英国伦敦大学学院的皮特.柯文尼教授称:“有可能通过病人的基因组序列,推断出酶的形状,构建准确的蛋白质三维结构,筛选匹配药物,并将结果告诉主治医生给出最优处方。”目前,研究团队已采用这一思路,对市场上在用的9种艾滋病治疗药物中的7种进行了排序验证。 科学家表示实际工作远比看起来复杂。目前他们建立的50多个模拟模型,就要配有5000个处理器的计算机不停的计算12-18个小时,还要对计算结果做大量的数据分析,才能给出药物的排序。今天的通用计算机技术很难胜任这样的工作,乐观的看,依当前计算机技术发展速度看,也许十年后真能实现计算机为病人“抓药”。

基因测序的应用领域

8. > 基因检测是基因测序吗

基因测序是测出DNA上的碱基是A,C,G,T中的哪一个;
而基因检测是通过杂交或测序等方法来确定DNA序列中是否含有特定的一段序列,来明确相关的基因某些功能。比如耳聋基因检测就是用芯片来检测一个正常人是否携带隐性先天性耳聋基因或者药敏性耳聋基因。
测序只是得到DNA的序列,而检测是最终要跟功能建立联系。